RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 STK39Q9UEW8 545 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANAPC2Q9UJX6 822 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF148Q9UQR1 794 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTBD3Q9Y2F9 522 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SQORQ9Y6N5 450 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1W2PPM1 405 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 A8MXE2 369 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLGNO14967 610 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTA2O94776 668 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CELF2O95319 508 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYF2O95926 243 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CH25HO95992 272 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLKB1P03952 638 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYBL1P10243 752 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCR10P46092 362 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ME1P48163 572 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDLIM4P50479 330 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCR3P51677 355 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAS2R38P59533 333 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZP1P60852 638 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ISL1P61371 349 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 COG7P83436 770 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TROAPQ12815 778 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RALGDSQ12967 914 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALCAMQ13740 583 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MORN5Q5VZ52 161 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGMBQ6NW40 437 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT74Q7RTS7 529 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 HAUS6Q7Z4H7 955 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLFN11Q7Z7L1 901 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TC2NQ8N9U0 490 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 POMGNT2Q8NAT1 580 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC4A11Q8NBS3 891 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR5R1Q8NH85 324 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFAP61Q8NHU2 1237 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAS1R2Q8TE23 839 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC38A5Q8WUX1 472 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SGCDQ92629 289 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 NXNL1Q96CM4 212 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RMDN1Q96DB5 314 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIPA1Q96FS4 1042 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 HARBI1Q96MB7 349 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRAMP1Q96RY5 1269 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 KXD1Q9BQD3 176 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RTN4RQ9BZR6 473 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEMA4CQ9C0C4 833 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR88Q9GZN0 384 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAD21L1Q9H4I0 556 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RABEP2Q9H5N1 569 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC4Q9HBW1 653 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 OLAHQ9NV23 265 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 HAO2Q9NYQ3 351 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SELENONQ9NZV5 590 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 C11orf21Q9P2W6 132 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJB4Q9UDY4 337 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF112Q9UJU3 913 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLHL20Q9Y2M5 609 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 H3BNX3 289 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM178BH3BS89 294 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 J3QR06 171 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP2K7O14733 419 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPRY3O43610 288 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 WISP2O76076 250 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KDM4BO94953 1096 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SOX30O94993 753 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PENKP01210 267 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms