RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 TPK1Q9H3S4 243 aa20.14■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.14■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa20.14■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TOR1BO14657 336 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CD4P01730 458 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 NTRK1P04629 796 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PNPLA4P41247 253 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 GP2P55259 537 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 DAOAP59103 153 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SELENBP1Q13228 472 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 MEP1AQ16819 746 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX29P2Q8IUI4 249 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PTERQ96BW5 349 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 NODALQ96S42 347 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 BTRCQ9Y297 605 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 M0R3G1 203 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 KPNA6O60684 536 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CYBBP04839 570 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 DIO3P55073 304 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CDKN2DP55273 166 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TPTEP56180 551 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 EMX2Q04743 252 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 MED10Q9BTT4 135 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 AIG1Q9NVV5 245 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 USP22Q9UPT9 525 aa20.13■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP6CO00743 305 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 C1RP00736 705 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 NPPAP01160 153 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 BMP4P12644 408 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PCMT1P22061 227 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CASP2P42575 452 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 OR4D2P58180 307 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 RANBP10Q6VN20 620 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNA7Q96RP8 456 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 EHD1Q9H4M9 534 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 UNCXA6NJT0 531 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 G3V2T6 193 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 INMTO95050 263 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SERPINB1P30740 379 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 MTHFRP42898 656 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TAF6P49848 677 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K7CLP57077 242 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ADCK1Q86TW2 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ITFG1Q8TB96 612 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIB2Q92519 343 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 MBOAT4Q96T53 435 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 GJD2Q9UKL4 321 aa20.12■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC22A3O75751 556 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CD1DP15813 335 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CCNA1P78396 465 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CHRNB3Q05901 458 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PIGFQ07326 219 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SV2CQ496J9 727 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 OSTM1Q86WC4 334 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CRCPO75575 148 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SOAT2O75908 522 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TEX37Q96LM6 180 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PIF1Q9H611 641 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 VTA1Q9NP79 307 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF19AQ9NV58 838 aa20.11■□□□□ 0.81
PPP1CC-201ENST00000335007 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms