RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324727.8

SCN4B-201, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN4B, Length 4,484 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4B-201ENST00000324727 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MGAT4DA6NG13 374 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBX1O43435 398 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CLTBP09497 229 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TYMPP19971 482 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PRIM2P49643 509 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 BNIP2Q12982 314 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PCID2Q5JVF3 399 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PGAM4Q8N0Y7 254 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 WDR48Q8TAF3 677 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3EA0A087X179 549 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3LB9A6J9 549 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3HP0C7X1 549 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ITIH1P19827 911 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GPR1P46091 355 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 JAM2P57087 298 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SQLEQ14534 574 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ANKS6Q68DC2 871 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 KLHL35Q6PF15 583 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF605Q86T29 641 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ADI1Q9BV57 179 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CDH19Q9H159 772 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 EHD1Q9H4M9 534 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RAD54BQ9Y620 910 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SPTA1P02549 2419 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FAM149AA5PLN7 773 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 E9PAM4 449 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TACR2P21452 398 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CXCR3P49682 368 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ABRQ12979 859 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CRY1Q16526 586 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF544Q6NX49 715 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MFSD3Q96ES6 412 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PANX3Q96QZ0 392 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 POLG2Q9UHN1 485 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.6□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 A0A1W2PPW3 197 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 IQCF5A8MTL0 148 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ITM2AO43736 263 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 EPN2O95208 641 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 EPHX1P07099 455 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CRABP2P29373 138 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CDKN2BP42772 138 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 NAB1Q13506 487 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SLC9A4Q6AI14 798 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PSMG2Q969U7 264 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PTPN18Q99952 460 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LAMA4Q16363 1823 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 EOMESO95936 686 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TFEBP19484 476 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 HOXD12P35452 270 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CHRNA4P43681 627 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MOGQ16653 247 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C11orf88Q6PI97 169 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.59□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms