RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 HAPLN3Q96S86 360 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SLC31A1O15431 190 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SPIBQ01892 262 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DEPDC4Q8N2C3 294 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 YIPF1Q9Y548 306 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 A0A0J9YYE9 177 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 IQCF5A8MTL0 148 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PMM2O15305 246 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TGDSO95455 350 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ASMTP46597 345 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 GRB14Q14449 540 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DEF8Q6ZN54 512 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NEK6Q9HC98 313 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CMPK1P30085 196 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 KIR3DL1P43629 444 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DYTNA2CJ06 578 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NRP2O60462 931 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CCL5P13501 91 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DGCR6Q14129 220 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DHRS12A0PJE2 317 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 EFCAB10A6NFE3 127 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZBTB22O15209 634 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PRG2P13727 222 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CDH3P22223 829 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ITPKBP27987 946 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TRAF3Q13114 568 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SHPRHQ149N8 1683 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ESR1P03372 595 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 LAPTM5Q13571 262 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DGUOKQ16854 277 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NEK5Q6P3R8 708 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 LEMD2Q8NC56 503 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 OR2T12Q8NG77 320 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 LCN9Q8WX39 176 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RNF39Q9H2S5 420 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DTLQ9NZJ0 730 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NMBRP28336 390 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 HSPA7P48741 367 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ACAP2Q15057 778 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PPM1JQ5JR12 505 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TTC27Q6P3X3 843 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 C11orf88Q6PI97 169 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PTGER3P43115 390 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PROSER1Q86XN7 944 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 IQCKQ8N0W5 287 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NTAN1Q96AB6 310 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ACDQ96AP0 544 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 IL12RB2Q99665 862 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SIX2Q9NPC8 291 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PHLPP1O60346 1717 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZNF132P52740 706 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TIMM22Q9Y584 194 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ABCC6O95255 1503 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 COL6A1P12109 1028 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TEAD4Q15561 434 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms