RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB2Q8N680 514 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PHC3Q8NDX5 983 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A7Q96T83 725 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RGS10O43665 173 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TREML2Q5T2D2 321 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ATG14Q6ZNE5 492 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DPF3Q92784 378 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TBATAQ96M53 351 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PMM2O15305 246 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TULP3O75386 442 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2B17O75795 530 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RIPK3Q9Y572 518 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN1O60635 241 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN9O95484 217 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A3P53794 718 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MPP1Q00013 466 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IL23RQ5VWK5 629 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ARL10Q8N8L6 244 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GPR152Q8TDT2 470 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP2Q99490 1192 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IPPKQ9H8X2 491 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 BCKDKO14874 412 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 NPHS1O60500 1241 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TRMUO75648 421 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 C1RP00736 705 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PBX3P40426 434 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP4Q13115 394 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LPIN1Q14693 890 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CLHC1Q8NHS4 586 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GMIPQ9P107 970 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM22Q9Y584 194 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GRM6O15303 877 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SCELO95171 688 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SSR2P43308 183 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RAB25P57735 213 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP1BP68106 108 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 REP15Q6BDI9 236 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SLC34A3Q8N130 599 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FIBCD1Q8N539 461 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PDPRQ8NCN5 879 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TFAP2BQ92481 460 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MIOSQ9NXC5 875 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GPR25O00155 361 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 IFNGP01579 166 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SPAM1P38567 509 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R41P59536 307 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC185Q8N715 623 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ALG2Q9H553 416 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TACR2P21452 398 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MPPE1Q53F39 396 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GSAPA4D1B5 854 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A2O15244 555 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ITPKAP23677 461 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CES5AQ6NT32 575 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SIX2Q9NPC8 291 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NR2E1Q9Y466 385 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FERD3LQ96RJ6 166 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM138Q9NPI0 162 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ASLP04424 464 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GABRR2P28476 465 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TGFBR2P37173 567 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf52Q5T4I8 152 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 RNF220Q5VTB9 566 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB46Q86UZ6 589 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF781Q8N8C0 355 aa21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms