RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266557.3

CD27-201, Transcript of CD27 molecule, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD27, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-201ENST00000266557 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 COX14Q96I36 57 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 HIC2Q96JB3 615 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 LGR4Q9BXB1 951 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 GSTA2P09210 222 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 THOP1P52888 689 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 GPX6P59796 221 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 OVGP1Q12889 678 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 SEMA3AQ14563 771 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 SLMAPQ14BN4 828 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 TEAD4Q15561 434 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 KCNMB4Q86W47 210 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 RAB21Q9UL25 225 aa14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD27-201ENST00000266557 TLR4O00206 839 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 VILLO15195 856 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 MAGEC1O60732 1142 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 SPAG6O75602 509 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 TUBBP07437 444 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ACRV1P26436 265 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 MPLP40238 635 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 DBN1Q16643 649 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 KYNUQ16719 465 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 NEPROQ6NW34 567 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 DOK6Q6PKX4 331 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 MACC1Q6ZN28 852 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 GPR150Q8NGU9 434 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 GDAP1Q8TB36 358 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 WDR92Q96MX6 357 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 TTC25Q96NG3 672 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 USP34Q70CQ2 3546 aa14.7□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 A0A1B0GVT2 93 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 TMEM202A6NGA9 273 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ASMTLO95671 621 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 RETP07949 1114 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ERVK-10P10266 1014 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 KELP23276 732 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 C21orf59P57076 290 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 NXPH1P58417 271 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 PTK2BQ14289 1009 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ITIH4Q14624 930 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 CEP76Q8TAP6 659 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 CALML6Q8TD86 181 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 SKA1Q96BD8 255 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 DMDP11532 3685 aa14.69□□□□□ -0.06
CD27-201ENST00000266557 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms