RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 AMZ1Q400G9 498 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MMEL1Q495T6 779 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SMIM29Q86T20 159 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GPAT4Q86UL3 456 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EFCAB13Q8IY85 973 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 DCLK2Q8N568 766 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SUN5Q8TC36 379 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TANKQ92844 425 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HES6Q96HZ4 224 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FEM1CQ96JP0 617 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 REEP2Q9BRK0 252 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MXRA8Q9BRK3 442 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM7Q9C029 511 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TAOK3Q9H2K8 898 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZWILCHQ9H900 591 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CHMP5Q9NZZ3 219 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 VDAC3Q9Y277 283 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NINLQ9Y2I6 1382 aa3.06□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PRR23AA6NEV1 266 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 H0YC42 278 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MCF2LO15068 1137 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KLK8O60259 260 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HSPA4LO95757 839 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TSPY4P0CV99 314 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TSPY10P0CW01 314 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 THEGLP0DJG4 465 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CD9P21926 228 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 POU1F1P28069 291 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TMOD1P28289 359 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 STX2P32856 288 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RWDD2BP57060 319 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 IL1RL1Q01638 556 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CDC16Q13042 620 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 VEPH1Q14D04 833 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 WDR73Q6P4I2 378 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NOXA1Q86UR1 476 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SFR1Q86XK3 245 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF619Q8N2I2 560 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 LRRC43Q8N309 656 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KBTBD3Q8NAB2 608 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FIG4Q92562 907 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SNAPC3Q92966 411 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KXD1Q9BQD3 176 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 DNAI2Q9GZS0 605 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HPF1Q9NWY4 346 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SPATA7Q9P0W8 599 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PSAT1Q9Y617 370 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SCRIBQ14160 1630 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 A0A0G2JPF8 293 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZBTB43O43298 467 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZBTB14O43829 449 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 STAM2O75886 525 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PAHP00439 452 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 APOA4P06727 396 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EEF2P13639 858 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FERP16591 822 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KCNA5P22460 613 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CHATP28329 748 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KRT9P35527 623 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms