RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261177.9

TSPAN11-201, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN11, Length 5,505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-201ENST00000261177 COL26A1Q96A83 441 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RHBGQ9H310 441 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FZD8Q9H461 694 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF221Q9UK13 617 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC22A2O15244 555 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RGS20O76081 388 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PIGRP01833 764 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 HTR1BP28222 390 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ASPAP45381 313 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TUBA4AP68366 448 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 BANPQ8N9N5 519 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PADI3Q9ULW8 664 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TREHO43280 583 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SSNA1O43805 119 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 OR10H3O60404 316 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SERPINA1P01009 418 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 BCAP31P51572 246 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LCP2Q13094 533 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SEMA5AQ13591 1074 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 HPS6Q86YV9 775 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SLCO2A1Q92959 643 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ASF1AQ9Y294 204 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 C1RP00736 705 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CAPGP40121 348 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 NOGQ13253 232 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GPR158Q5T848 1215 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LIN54Q6MZP7 749 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 UROSP10746 265 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SELPP16109 830 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 BMP7P18075 431 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RCVRNP35243 200 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 DAOAP59103 153 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ROPN1LQ96C74 230 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LRATO95237 230 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LILRA4P59901 499 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MTX3Q5HYI7 312 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LPCAT4Q643R3 524 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GLYATQ6IB77 296 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CHADLQ6NUI6 762 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 IGFLR1Q9H665 355 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CMTM6Q9NX76 183 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GIN1Q9NXP7 522 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ACSL4O60488 711 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GLUD1P00367 558 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MTAPQ13126 283 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CBX3Q13185 183 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PEX6Q13608 980 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PPM1JQ5JR12 505 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SGK2Q9HBY8 427 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 BTBD19C9JJ37 291 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ATG13O75143 517 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TRBC1P01850 177 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CLCNKBP51801 687 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 IL10RBQ08334 325 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TAC4Q86UU9 113 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SIX5Q8N196 739 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PCED1BQ96HM7 432 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF222Q9UK12 451 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FKTNO75072 461 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TIPRLO75663 272 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 STK16O75716 305 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CAPN15O75808 1086 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PRG2P13727 222 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 AMD1P17707 334 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SCNN1AP37088 669 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms