RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000033012.8

Copb1-201, Transcript of Coatomer subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Copb1, Length 3,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cyp4f17G3UW78 524 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gsx2P31316 305 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Rab12P35283 243 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Lhx5P61375 402 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Npy2rP97295 381 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sh3bp2Q06649 559 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Srebf2Q3U1N2 1130 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Klra2Q60660 288 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Noc4lQ8BHY2 516 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr450Q8VF81 310 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr330Q8VGD9 315 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 BniplQ99JU7 328 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Q99LU8 229 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 LrgukQ9D5S7 820 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ubiad1Q9DC60 336 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sacm1lQ9EP69 587 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mpp6Q9JLB0 553 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Psma4Q9R1P0 261 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gsk3bQ9WV60 420 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Adgra2Q91ZV8 1336 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Serpina3iD3Z450 408 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Maml2F6U238 1170 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 C9P06683 548 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 TP20293 436 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pou3f2P31360 445 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gpx3P46412 226 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Psma2P49722 234 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Atp6v1e1P50518 226 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ctps2P70303 586 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 LvrnQ2KHK3 559 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Eef2kmtQ3UZW7 335 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vps72Q62481 368 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slc38a4Q8R1S9 547 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Impg1Q8R1W8 798 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Scpep1Q920A5 452 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Rilpl2Q99LE1 197 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Bcl7aQ9CXE2 210 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Trmt44Q9D2Q2 713 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 PolmQ9JIW4 496 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ehd3Q9QXY6 535 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Itga8A2ARA8 1062 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slc28a1E9PXX9 648 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Usp17lbE9Q9U0 468 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ptch2O35595 1182 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Nfkb1P25799 971 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Apoc3P33622 99 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Fmo3P97501 534 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Faf2Q3TDN2 445 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ulk3Q3U3Q1 472 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Dcdc2Q5DU00 475 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Kank2Q8BX02 843 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 March11Q8CBH7 400 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cavin3Q91VJ2 260 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pcdha9Q91Y11 979 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Grip1Q925T6 1127 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Nudt8Q9CR24 210 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Kctd4Q9D7X1 259 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olig1Q9JKN5 260 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 CasrQ9QY96 1079 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mapk11Q9WUI1 364 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 CitP49025 2055 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 NynrinQ5DTZ0 1840 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Scn9aQ62205 1984 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn2r14E9Q759 848 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 MaptP10637 733 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Hoxd12P23812 268 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Kcnab2P62482 367 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ntsr2P70310 416 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Smyd5Q3TYX3 416 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Lrrc58Q3UGP9 366 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Klhdc9Q3USL1 350 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Zfp974Q3UVF6 752 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tmem202Q80W35 275 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mettl27Q8BGM4 238 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Zbtb20Q8K0L9 741 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sgpl1Q8R0X7 568 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cdt1Q8R4E9 557 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Nprl3Q8VIJ8 569 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 NrarpQ91ZA8 114 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Riok2Q9CQS5 547 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mageb3Q9D2H4 330 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 S100pbpQ9D5K4 396 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cst12Q9DAN8 128 aa9.98□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 4930433I11RikA0A0U1RPT6 723 aa9.97□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 A0A286YDM2 672 aa9.97□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cypt3B1AY64 174 aa9.97□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 H2al1oL7MU04 110 aa9.97□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 UgcgO88693 394 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.8 ms