RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641106.1

CASC19-211, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,184 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-211ENST00000641106 LHX3Q9UBR4 397 aa7.23□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.23□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.23□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.23□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 WASH4PA8MWX3 477 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 K7ESM1 405 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 INSIG1O15503 277 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 KDELR3O43731 214 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 TMCC1O94876 653 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 MT-CO3P00414 261 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 UGT2B4P06133 528 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 THBDP07204 575 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 KRT3P12035 628 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 CKMT1AP12532 417 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 ATP1A3P13637 1013 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 DRD2P14416 443 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 GPD1P21695 349 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 STAT1P42224 750 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 DNA2P51530 1060 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 KCTD16Q68DU8 428 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 RBFAQ8N0V3 343 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 CENPTQ96BT3 561 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 APOLD1Q96LR9 279 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 PEBP4Q96S96 227 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 PDFQ9HBH1 243 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 TMEM51Q9NW97 253 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 FZD10Q9ULW2 581 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC19-211ENST00000641106 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 KRIT1O00522 736 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SCAMP1O15126 338 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 GSTA4O15217 222 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 RAMP2O60895 175 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PIGNO95427 931 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CDK4P11802 303 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 RAB6AP20340 208 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ABCG1P45844 678 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 RGRP47804 291 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 MYL5Q02045 173 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SEMG2Q02383 582 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 GBX1Q14549 363 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CYTH1Q15438 398 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CA9Q16790 459 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 MYLK3Q32MK0 819 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 GUSBP11Q6P575 273 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PCSK4Q6UW60 755 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 BEND4Q6ZU67 534 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PARGQ86W56 976 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 NEK11Q8NG66 645 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ASB12Q8WXK4 309 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 HMCESQ96FZ2 354 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FEM1CQ96JP0 617 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SCYL1Q96KG9 808 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 MCEEQ96PE7 176 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms