RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PANX1Q96RD7 426 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 AGAP2Q99490 1192 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SRRDQ9UH36 339 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 H3BN98 237 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ABLIM1O14639 778 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PLIN3O60664 434 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF1O95521 474 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 EPORP19235 508 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 HOXD13P35453 343 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 KCNJ2P63252 427 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CLCQ05315 142 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RNF148Q8N7C7 305 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GPR21Q99679 349 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLITRK2Q9H156 845 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 FANCEQ9HB96 536 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ASF1AQ9Y294 204 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SCN7AQ01118 1682 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC189A1A4V9 331 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TM7SF2O76062 418 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 EDNRBP24530 442 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 HSD17B2P37059 387 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MPP1Q00013 466 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 INAQ16352 499 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM192Q8IY95 271 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ACDQ96AP0 544 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf50Q9BV19 199 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CPQQ9Y646 472 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 H3BM21 787 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 UBXN8O00124 270 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GSC2O15499 205 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CST1P01037 141 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TCF3P15923 654 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 UGT2B15P54855 530 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 COPZ1P61923 177 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CA9Q16790 459 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MTX3Q5HYI7 312 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CPTPQ5TA50 214 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SNX20Q7Z614 316 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PSMG2Q969U7 264 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PIRO00625 290 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SIN3BO75182 1162 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 UGT2B11O75310 529 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 STK16O75716 305 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DLGAP3O95886 979 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C4BPBP20851 252 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 NSG1P42857 185 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF132P52740 706 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP8P85298 464 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PDK3Q15120 406 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GPR33Q49SQ1 333 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 REP15Q6BDI9 236 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.43□□□□□ -1.38
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