RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MGAT1	P26572	445 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LBX1	P52954	281 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PMS2P3	Q13401	168 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PRPSAP1	Q14558	356 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD11	Q693B1	232 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	USP33	Q8TEY7	942 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	YME1L1	Q96TA2	773 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IL12RB2	Q99665	862 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ADI1	Q9BV57	179 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EHD1	Q9H4M9	534 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PSME2	Q9UL46	239 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	YIPF1	Q9Y548	306 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HEATR9	A2RTY3	570 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DRGX	A6NNA5	263 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PSMD3	O43242	534 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	APOA4	P06727	396 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PPM1A	P35813	382 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MPP1	Q00013	466 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRAF2	Q12933	501 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MTX3	Q5HYI7	312 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HECTD3	Q5T447	861 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FBXL22	Q6P050	247 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CASC4	Q6P4E1	433 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TANK	Q92844	425 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ISL2	Q96A47	359 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MYRFL	Q96LU7	910 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NAT9	Q9BTE0	207 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SARDH	Q9UL12	918 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659		J3QRK9	145 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CACNG3	O60359	315 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CNTN5	O94779	1100 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MERTK	Q12866	999 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	STX5	Q13190	355 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VEPH1	Q14D04	833 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SPCS2	Q15005	226 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TAF12	Q16514	161 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC36A3	Q495N2	470 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ALF	Q53S48	1182 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RDH11	Q8TC12	318 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IGSF8	Q969P0	613 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FBXL8	Q96CD0	374 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FEM1C	Q96JP0	617 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CIB1	Q99828	191 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM15	Q9C019	465 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CASS4	Q9NQ75	786 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CDYL	Q9Y232	598 aa		15.25	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM13	O60858	407 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PGAM1	P18669	254 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HLCS	P50747	726 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KCNQ1	P51787	676 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf183	Q5T699	404 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GPR65	Q8IYL9	337 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CADM3	Q8N126	398 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CALML6	Q8TD86	181 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HPS1	Q92902	700 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OR52B2	Q96RD2	323 aa		15.24	■□□□□ 0.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms