RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FERP16591 822 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 AMPD1P23109 780 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 F8A1P23610 371 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CD97P48960 835 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 UBXN1Q04323 297 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP7Q14244 749 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 IYDQ6PHW0 289 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PLXDC1Q8IUK5 500 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC13Q8IYE1 715 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 HERPUD2Q9BSE4 406 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM7Q9C029 511 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ETNK2Q9NVF9 386 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 POLHQ9Y253 713 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX15Q9BXT5 2789 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EM74 188 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 MAFKO60675 156 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS4BO75351 444 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 AGFG2O95081 481 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF30P17039 623 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PTSQ03393 145 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SMTNL2Q2TAL5 461 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTN3Q6NUS6 607 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 COX14Q96I36 57 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 EPB41L1Q9H4G0 881 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM8Q9NQV8 689 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCLQ9NW38 375 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS4AQ9UN37 437 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIL1Q9Y3C6 166 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC14CA4D256 554 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM191CA6NGB0 347 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS16A8MUM7 142 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 LRCH4O75427 683 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 RFPL1O75677 317 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB3Q8N7B9 438 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT6Q8NCL4 622 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPH1Q92598 858 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS18Q9P253 973 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC6O75061 913 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF28P17035 718 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCRFS1P47985 274 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 STC1P52823 247 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH6P55285 790 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 GFERP55789 205 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 RASGRP3Q8IV61 690 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ELMO2Q96JJ3 720 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CPNE7Q9UBL6 633 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JNG1 304 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0J9YYE9 177 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DS3K7RE56 304 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBC1P01850 177 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 F3P13726 295 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINB6P35237 376 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPHS1P49903 392 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DS5Q14953 304 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP8Q86W28 1048 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 AVL9Q8NBF6 648 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TWSG1Q9GZX9 223 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DNPEPQ9ULA0 475 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL3Q9Y4R7 772 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 NOTCH2Q04721 2471 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0754O94854 1291 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD34CP0C6C1 535 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 FHL5Q5TD97 284 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TGM7Q96PF1 710 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CSPG4P5Q96PW8 444 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TLK1Q9UKI8 766 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LILRA5A6NI73 299 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5K4A6NMS3 321 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL8A6PVC2 850 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD6O60353 706 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN7O95471 211 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 FURINP09958 794 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP1A3P13637 1013 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TYRP1P17643 537 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 GNLYP22749 145 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DPYSL2Q16555 572 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 POLNQ7Z5Q5 900 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM135Q86UB9 458 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM48Q8IWZ4 208 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF653Q96CK0 615 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf72Q96LT7 481 aa27.05■■□□□ 1.92
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