RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 EQTNQ9NQ60 294 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 LRCH4O75427 683 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 DAOAP59103 153 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NAE1Q13564 534 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SPESP1Q6UW49 350 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SUV39H1O43463 412 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CCL5P13501 91 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TTC23Q5W5X9 447 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 HNMTP50135 292 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 RAB30Q15771 203 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 GPR21Q99679 349 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CACNA2D1P54289 1103 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 IL10RBQ08334 325 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 FFAR2O15552 330 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 AP2A1O95782 977 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ASLP04424 464 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NT5EP21589 574 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NRF1Q16656 503 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SH3GL2Q99962 352 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 STK16O75716 305 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MATN4O95460 622 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 USP46P62068 366 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TTMPQ5BVD1 217 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MZT2AQ6P582 158 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 FAM129CQ86XR2 697 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 APOLD1Q96LR9 279 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 C3orf18Q9UK00 162 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NFKBIEO00221 500 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CST1P01037 141 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 IL6P05231 212 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 LMO2P25791 158 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 HID1Q8IV36 788 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NRP1O14786 923 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SYN1P17600 705 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MASP1P48740 699 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 A0A087WXM4 84 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 BLKP51451 505 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 STK32AQ8WU08 396 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 ALG3Q92685 438 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 MIOSQ9NXC5 875 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 SESN1Q9Y6P5 492 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 COL6A2P12110 1019 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 GNPDA1P46926 289 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 C5orf34Q96MH7 638 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 PSMG1O95456 288 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 NUDT17P0C025 328 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 FSHRP23945 695 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 UGT1A5P35504 534 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 UBXN11Q5T124 520 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 IRGCQ6NXR0 463 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 TBATAQ96M53 351 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 RPIAP49247 311 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 TSSK3Q96PN8 268 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDP1-208ENST00000613122 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms