RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	PDE9A	O76083	593 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	MPST	P25325	297 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CDC42	P60953	191 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CA9	Q16790	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SLC6A2	P23975	617 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CPTP	Q5TA50	214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	BTBD9	Q96Q07	612 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	HLA-DQA2	P01906	255 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SLC7A2	P52569	658 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	PPM1J	Q5JR12	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ZBTB22	O15209	634 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SLC7A4	O43246	635 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TRBC1	P01850	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SYN1	P17600	705 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CCR3	P51677	355 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151		A0A087WXM4	84 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	BCL10	O95999	233 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ESR1	P03372	595 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	BMP7	P18075	431 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SCNN1A	P37088	669 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RANBP1	P43487	201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SEC13	P55735	322 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TRIM24	O15164	1050 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	NRP2	O60462	931 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	NMBR	P28336	390 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151		C9IYK1	514 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	ASL	P04424	464 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	KCNE1	P15382	129 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	PTGER3	P43115	390 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	HSPA7	P48741	367 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	GJA9	P57773	515 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	PTS	Q03393	145 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RAB18-208	ENST00000611151	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		13.71	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms