RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM135	Q86UB9	458 aa		21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	IQCH	Q86VS3	1027 aa		21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	OR13H1	Q8NG92	308 aa		21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	SCAMP4	Q969E2	229 aa		21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	CAVIN3	Q969G5	261 aa		21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	AP2M1	Q96CW1	435 aa		21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	21.84	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	CACNA1E	Q15878	2313 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026		K7ESM1	405 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	PHB	P35232	272 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	TMPRSS15	P98073	1019 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	BNC1	Q01954	994 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	DPT	Q07507	201 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	CRYM	Q14894	314 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	CSRP2	Q16527	193 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	KYNU	Q16719	465 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	ALS2CL	Q60I27	953 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	STEAP4	Q687X5	459 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	CES3	Q6UWW8	571 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026		Q6ZSR6	202 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	21.83	■■□□□ 1.09	3e-12	■■■■■ 38.1
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	MFSD3	Q96ES6	412 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF778	Q96MU6	729 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	GPR27	Q9NS67	375 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	TREX1	Q9NSU2	369 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		21.83	■■□□□ 1.09
LTBP4-227	ENST00000600026	TLR4	O00206	839 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	BPI	P17213	487 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TGM1	P22735	817 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	RABIF	P47224	123 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	C21orf59	P57076	290 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	PRAME	P78395	509 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	IRX4	P78413	519 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	ACVR1	Q04771	509 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	GRIK2	Q13002	908 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	INPP5A	Q14642	412 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	PTPRCAP	Q14761	206 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	PNCK	Q6P2M8	343 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	GPR26	Q8NDV2	337 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	SKA1	Q96BD8	255 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	AGAP2	Q99490	1192 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CDH19	Q9H159	772 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	APPL1	Q9UKG1	709 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	LRP4	O75096	1905 aa		21.82	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	MAGEC1	O60732	1142 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	SOD1	P00441	154 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	PSMA3	P25788	255 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	SPAM1	P38567	509 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CTSK	P43235	329 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	GPR1	P46091	355 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	NXPH1	P58417	271 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	DCDC1	P59894	354 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	OVGP1	Q12889	678 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	LONRF1	Q17RB8	773 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	KIF19	Q2TAC6	998 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	NLRP8	Q86W28	1048 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	APOO	Q9BUR5	198 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		21.81	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		21.8	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	21.8	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		21.8	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	LNP1	A1A4G5	178 aa		21.8	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	ARHGAP33	O14559	1287 aa		21.8	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TOR1B	O14657	336 aa		21.8	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	ENG	P17813	658 aa		21.8	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TEAD1	P28347	426 aa		21.8	■■□□□ 1.08
LTBP4-227	ENST00000600026	SSTR1	P30872	391 aa		21.8	■■□□□ 1.08

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