RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 SHC3Q92529 594 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 MR1Q95460 341 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CEP63Q96MT8 703 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TMEM51Q9NW97 253 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ASMTLO95671 621 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 FOLR1P15328 257 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 AMD1P17707 334 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 SLC9A1P19634 815 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 LHCGRP22888 699 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 VIPR1P32241 457 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PTGER4P35408 488 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 SCNN1AP37088 669 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TUBB3Q13509 450 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 LRP8Q14114 963 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 LCN10Q6JVE6 187 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CUZD1Q86UP6 607 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 GPT2Q8TD30 523 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 RARRES3Q9UL19 164 aa14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.61□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 LILRA5A6NI73 299 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 E2F3O00716 465 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 UBXN7O94888 489 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ZNF202O95125 648 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ACP5P13686 325 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 COX6B1P14854 86 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CA5AP35218 305 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CSNK1DP48730 415 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 SCNN1BP51168 640 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ATP1A4Q13733 1029 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PKP1Q13835 747 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 LLGL1Q15334 1064 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PARP15Q460N3 678 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CCDC14Q49A88 953 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ISM2Q6H9L7 571 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 KCNMB4Q86W47 210 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 RSC1A1Q92681 617 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 SCAMP4Q969E2 229 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 AGAP2Q99490 1192 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CHST8Q9H2A9 424 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PDE7BQ9NP56 450 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 SNX7Q9UNH6 387 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CREB3O43889 395 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PRAMEF11O60813 436 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PALMO75781 387 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 F3P13726 295 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TEAD1P28347 426 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PPP1CAP62136 330 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 GPS2Q13227 327 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 TAF3Q5VWG9 929 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ATL3Q6DD88 541 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 IRGCQ6NXR0 463 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 NXPE1Q8N323 547 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ZBTB2Q8N680 514 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 ABCG8Q9H221 673 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-216ENST00000550632 RMND1Q9NWS8 449 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms