RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530170.1

RPS3-215, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 531 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-215ENST00000530170 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.13□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 SCN5AQ14524 2016 aa9.13□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 CCDC78A2IDD5 438 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 NEMP2A6NFY4 417 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 RFXAPO00287 272 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 GFRA2O00451 464 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MRASO14807 208 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 AZIN1O14977 448 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MUSKO15146 869 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 NRP2O60462 931 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 DNAJA2O60884 412 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 CDK14O94921 469 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MLYCDO95822 493 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 NPPAP01160 153 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ALDH2P05091 517 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 IDO1P14902 403 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 CSF2RAP15509 400 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 VCLP18206 1134 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ATF6P18850 670 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.951e-20■■□□□ 13.9
RPS3-215ENST00000530170 SLC7A1P30825 629 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ACVRL1P37023 503 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 DPP6P42658 865 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MAPK8P45983 427 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 CCR10P46092 362 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 CHN2P52757 468 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 AQP4P55087 323 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ITKQ08881 620 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ADRM1Q16186 407 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 FXNQ16595 210 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 SMU1Q2TAY7 513 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 XKR7Q5GH72 579 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 GPR158Q5T848 1215 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 RASIP1Q5U651 963 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 TMEM198Q66K66 360 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 NXNQ6DKJ4 435 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 LCN8Q6JVE9 175 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 LGI2Q8N0V4 545 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 TMEM199Q8N511 208 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 TBATAQ96M53 351 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 LRGUKQ96M69 825 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 CDRT15Q96T59 188 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 EBF3Q9H4W6 596 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ALG9Q9H6U8 611 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MED16Q9Y2X0 877 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 C2orf81A6NN90 581 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 TMEM233B4DJY2 109 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ENPP3O14638 875 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 VPS26AO75436 327 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 GPC4O75487 556 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ZMPSTE24O75844 475 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 STAMBPO95630 424 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 OLFM2O95897 454 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ESR1P03372 595 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 F11P03951 625 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 GALTP07902 379 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 MYOGP15173 224 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 LBPP18428 481 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 GPX3P22352 226 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3-215ENST00000530170 PKNOX1P55347 436 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms