RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	DYTN	A2CJ06	578 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	C2orf78	A6NCI8	922 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	TMEM233	B4DJY2	109 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999		H3BNX3	289 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	UBXN8	O00124	270 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	TSPAN3	O60637	253 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ECI2	O75521	394 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	GJB3	O75712	270 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PGLS	O95336	258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	STAMBP	O95630	424 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ESRRB	O95718	433 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	FGF19	O95750	216 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PDHA1	P08559	390 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	UROS	P10746	265 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CCL5	P13501	91 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	IDO1	P14902	403 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	RAG1	P15918	1043 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	GPX3	P22352	226 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	HSPA13	P48723	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	SGSH	P51688	502 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	TRAF2	Q12933	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CEACAM7	Q14002	265 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	FLOT2	Q14254	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PTPRCAP	Q14761	206 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PFKFB4	Q16877	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	GPSM1	Q86YR5	675 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	MIER2	Q8N344	545 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	GPR21	Q99679	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999		Q9H521	79 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	IL21	Q9HBE4	155 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	GID8	Q9NWU2	228 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	VPS51	Q9UID3	782 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	GIPC1	O14908	333 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	TRIM24	O15164	1050 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	SNX2	O60749	519 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	SUPT3H	O75486	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	TSPAN12	O95859	305 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PIRT	P0C851	137 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PRR35	P0CG20	571 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	UQCRB	P14927	111 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	VEGFB	P49765	207 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	THOP1	P52888	689 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	BCL2L1	Q07817	233 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PEX6	Q13608	980 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CDH18	Q13634	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	SMU1	Q2TAY7	513 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	REP15	Q6BDI9	236 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PUF60-213	ENST00000528999	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		10.62	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms