RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	GPR21	Q99679	349 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	TNFRSF10B	O14763	440 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	SLC7A4	O43246	635 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	ECI2	O75521	394 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	PIGF	Q07326	219 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	EFHB	Q8N7U6	833 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	MROH6	A6NGR9	719 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	KATNA1	O75449	491 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	OR4D2	P58180	307 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	TNK2	Q07912	1038 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	BNIP3	Q12983	259 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF235	Q14590	738 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	OR2T11	Q8NH01	316 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	NIPSNAP2	O75323	286 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	FDXR	P22570	491 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	HOXC13	P31276	330 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	KCNK10	P57789	538 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	SYVN1	Q86TM6	617 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	OR7D4	Q8NG98	312 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	TOP1MT	Q969P6	601 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	PKMYT1	Q99640	499 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	RAMP2	O60895	175 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	CYP2C18	P33260	490 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	DGKQ	P52824	942 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF33A	Q06730	810 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	SELPLG	Q14242	412 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	OR4L1	Q8NH43	312 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	ROPN1L	Q96C74	230 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MIB2-231	ENST00000518681	SLC12A8	A0AV02	714 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681		J3QRK9	145 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	C1R	P00736	705 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	RGR	P47804	291 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	MAP2K5	Q13163	448 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	LAPTM5	Q13571	262 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	FBXL8	Q96CD0	374 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	THAP11	Q96EK4	314 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF225	Q9UK10	706 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681		A0A087WXM4	84 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ACOX3	O15254	700 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	OR4F21	O95013	312 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ITGB6	P18564	788 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	IL12A	P29459	219 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ACADVL	P49748	655 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	CCT8	P50990	548 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ATP6V0D1	P61421	351 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	RAB39A	Q14964	217 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ADRM1	Q16186	407 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	AFMID	Q63HM1	303 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	BORA	Q6PGQ7	559 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	SERPINB11	Q96P15	392 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	EXD2	Q9NVH0	621 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	BMP1	P13497	986 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	PTPRN	Q16849	979 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	PADI4	Q9UM07	663 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	CCDC154	A6NI56	674 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
MIB2-231	ENST00000518681	KCNH1	O95259	989 aa		18.75	■□□□□ 0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms