RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPC24	Q8NBT2	197 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR48	Q8TAF3	677 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTL9	Q8TC94	416 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2M4	Q96R27	311 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	SATB2	Q9UPW6	733 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC66	A2RUB6	948 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTSS1	O43312	755 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	B4GAT1	O43505	415 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ECEL1	O95672	775 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPI	P17213	487 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CA5A	P35218	305 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPIDR	Q14159	915 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNJL	Q8IV13	435 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL14	Q8N4G2	192 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGF11	Q92914	225 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	VAT1	Q99536	393 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS18	Q9P253	973 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	LHX6	Q9UPM6	363 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNA1G	O43497	2377 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014		A6NCN8	305 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPM1D	O15297	605 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPO	P01588	193 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTR1B	P42025	376 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	RWDD2B	P57060	319 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTR1A	P61163	376 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	OLIG2	Q13516	323 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC1A5	Q15758	541 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALS2CL	Q60I27	953 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PID1	Q7Z2X4	250 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH19	Q9H159	772 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GBA3	Q9H227	469 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR19	A6NJB7	356 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014		H7C0C1	242 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUAK1	O60285	661 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASMTL	O95671	621 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	FTCD	O95954	541 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC4A1	P02730	911 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCKBR	P32239	447 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADRA1A	P35348	466 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTN2	P35609	894 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP5O	P48047	213 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1D5	P58170	312 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFHR1	Q03591	330 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms