RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM125Q96AQ2 219 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 MUC3BQ9H195 1237 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXO44Q9H4M3 255 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ALG2Q9H553 416 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 CIDEBQ9UHD4 219 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF112Q9ULX5 631 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM64CA6NLI5 447 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ACOX3O15254 700 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 CRCPO75575 148 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 EPOP01588 193 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXM1Q08050 763 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6AP1Q15904 470 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 BIRC8Q96P09 236 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM54Q9BYV2 358 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 SYTL2Q9HCH5 934 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0J9YVX5 310 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS4BO75351 444 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 CYBBP04839 570 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1E1P30953 314 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 NFYCQ13952 458 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TNIP2Q8NFZ5 429 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 CLIC3O95833 236 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 GPIP06744 558 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 AKR1A1P14550 325 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 OGNP20774 298 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 GSK3BP49841 420 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ADARP55265 1226 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 LPIN1Q14693 890 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 PARP15Q460N3 678 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 SPATS1Q496A3 300 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKS6Q68DC2 871 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR152Q8TDT2 470 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 IKZF3Q9UKT9 509 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHB8Q9UN66 801 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 MED16Q9Y2X0 877 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 PATJQ8NI35 1801 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 BAIAP3O94812 1187 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 RHOBTB1O94844 696 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 RASAL1O95294 804 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 FMO4P31512 558 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ZBED5Q49AG3 693 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 OGFOD2Q6N063 350 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 SPRED1Q7Z699 444 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPEARQ8WU66 669 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 CYGBQ8WWM9 190 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF599Q96NL3 588 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 DERL2Q9GZP9 239 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 KPNA6O60684 536 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 SOX11P35716 441 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNK10P57789 538 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 RCAN2Q14206 197 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 DSC3Q14574 896 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF235Q14590 738 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TSNQ15631 228 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TYSND1Q2T9J0 566 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 FUT11Q495W5 492 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 PAGE3Q5JUK9 113 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TMTC4Q5T4D3 741 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R13Q9NYV9 303 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 EBF1Q9UH73 591 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 BRCA2P51587 3418 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ASPDHA6ND91 283 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM64A6NGJ6 449 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 DRGXA6NNA5 263 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 PFDN1O60925 122 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ECI2O75521 394 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 HMBSP08397 361 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ISOC1Q96CN7 298 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 SLAMF8Q9P0V8 285 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 LCHNA4D1U4 455 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 GLTPD2A6NH11 291 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 EI24O14681 340 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 PRR35P0CG20 571 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 NCK1P16333 377 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 LIPEQ05469 1076 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 SPATA19Q7Z5L4 167 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 SEPT8Q92599 483 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXL20Q96IG2 436 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 B4GALT3O60512 393 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 FCGR1AP12314 374 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 GALK1P51570 392 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 CTBSQ01459 385 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 C8orf48Q96LL4 319 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 TCRBV5S2A0A599 114 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-221ENST00000511747 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms