RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	IKBKB	O14920	756 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	VILL	O15195	856 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	DAB1	O75553	588 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2C1	O95371	312 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM11	P17152	192 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ITGB6	P18564	788 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CCKBR	P32239	447 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	UBA7	P41226	1012 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	FASLG	P48023	281 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CDH8	P55286	799 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	TAS2R38	P59533	333 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CUL4A	Q13619	759 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	WTAP	Q15007	396 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	DECR1	Q16698	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A0G2JPF8	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CLGN	O14967	610 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CLTB	P09497	229 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	S1PR1	P21453	382 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	MCM3	P25205	808 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ACTN2	P35609	894 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	SNX16	P57768	344 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	PDE1B	Q01064	536 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CREB5	Q02930	508 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	LRMP	Q12912	555 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CDC16	Q13042	620 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	COASY	Q13057	564 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	FIG4	Q92562	907 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HS3ST1	O14792	307 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC16A5	O15375	505 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	FIBP	O43427	364 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	AHCYL1	O43865	530 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HS6ST1	O60243	411 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPAN9	O75954	239 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRK-215	ENST00000498284	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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