RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494136.1

LAMTOR4-212, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 2

Gene LAMTOR4, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-212ENST00000494136 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC89Q8N998 374 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GDAP1Q8TB36 358 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GLYATL1Q969I3 302 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 COX14Q96I36 57 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 FICDQ9BVA6 458 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 STRADBQ9C0K7 418 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 DKK4Q9UBT3 224 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 APPL1Q9UKG1 709 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 AK5Q9Y6K8 562 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 IGF2RP11717 2491 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 C5orf60A6NFR6 353 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 E7EVH7 732 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZSCAN12O43309 604 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CSO75390 466 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 SOD1P00441 154 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 PNLIPP16233 465 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 HADHAP40939 763 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 LMAN1P49257 510 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 IHHQ14623 411 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 PTPRRQ15256 657 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 INSCQ1MX18 579 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 PARP6Q2NL67 630 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRIM74Q86UV6 250 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCNJLQ8IV13 435 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 LSMEM2Q8N112 164 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 PELI3Q8N2H9 469 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPR156Q8NFN8 814 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 TMEM74Q96NL1 305 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 VPS35Q96QK1 796 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 SMIM14Q96QK8 99 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 U3KQA8 63 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 KNTC1P50748 2209 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 A0A0U1RQS6 177 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 KLHL33A6NCF5 533 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 OR5K4A6NMS3 321 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 D6RAR5 112 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CFAP99D6REC4 459 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GRID2O43424 1007 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 NUAK1O60285 661 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 NOBOXO60393 691 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 RALBP11234 206 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ACP5P13686 325 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 BPIP17213 487 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 ITGALP20701 1170 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 AKT1P31749 480 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 FDFT1P37268 417 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CHRNA4P43681 627 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPR3P46089 330 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCZ1BP86790 482 aa8.37□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms