RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 FOXM1Q08050 763 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 FRG2Q64ET8 278 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 AACSQ86V21 672 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 HM13Q8TCT9 377 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 DGAT2Q96PD7 388 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 FZD10Q9ULW2 581 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 A8MXE2 369 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM23O14925 209 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TBX10O75333 385 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 EGFP01133 1207 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 GH2P01242 217 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 LCATP04180 440 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 FASLGP48023 281 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 RFX2P48378 723 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 RAD23AP54725 363 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 PPATQ06203 517 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TRAF1Q13077 416 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 RABEP1Q15276 862 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC190Q86UF4 302 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 APBB2Q92870 758 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 PTERQ96BW5 349 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 WDR26Q9H7D7 661 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC18Q9H819 358 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 BECN2A8MW95 431 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 J3KR12 359 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SOCS2O14508 198 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SPINT2O43291 252 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 KRT33BQ14525 404 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TWIST1Q15672 202 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 DLG2Q15700 870 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 CRY2Q49AN0 593 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 VSIG1Q86XK7 387 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 GGPS1O95749 300 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 QDPRP09417 244 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 PRLRP16471 622 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 GJA1P17302 382 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF1BP20333 461 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 PPP5CP53041 499 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 ALCAMQ13740 583 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 HNF4GQ14541 408 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 PLCB4Q15147 1175 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 CHST3Q7LGC8 479 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 ORAI1Q96D31 301 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 RMDN1Q96DB5 314 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA17Q96L03 361 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 GDE1Q9NZC3 331 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SQORQ9Y6N5 450 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 OR6C75A6NL08 312 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 RGS14O43566 566 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 VPREB1P12018 145 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 BDKRB2P30411 391 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 MXI1P50539 228 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 ROR1Q01973 937 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 EFNB3Q15768 340 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 DECR1Q16698 335 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 LPGAT1Q92604 370 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 CDRT15Q96T59 188 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-212ENST00000491302 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.65□□□□□ -1.18
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