RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 LMO7DNF2Z398 122 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 LDB2O43679 373 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 DNAJC6O75061 913 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 ANXA6P08133 673 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 KELP23276 732 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 MSNP26038 577 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 AK4P27144 223 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 FDFT1P37268 417 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 COILP38432 576 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 ACADVLP49748 655 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 VPS41P49754 854 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 BLKP51451 505 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 SEMA5AQ13591 1074 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 POU6F1Q14863 301 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 CYP1B1Q16678 543 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 CERCAMQ5T4B2 595 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 ATL2Q8NHH9 583 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 BRSK1Q8TDC3 778 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 NAT14Q8WUY8 206 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 CAPZA3Q96KX2 299 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 LRRC40Q9H9A6 602 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 SIRPGQ9P1W8 387 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 PAK5Q9P286 719 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 ATXN10Q9UBB4 475 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 FKBPLQ9UIM3 349 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 WASF3Q9UPY6 502 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 GPSM3Q9Y4H4 160 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 PTPRBP23467 1997 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.48
NISCH-210ENST00000488157 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 STX7O15400 261 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 PSMD3O43242 534 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 DKK1O94907 266 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 IVLP07476 585 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 CKMT2P17540 419 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 LPOP22079 712 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 PMLP29590 882 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ACTN2P35609 894 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 SPAM1P38567 509 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ADCY8P40145 1251 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 LMAN1P49257 510 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 CCDC38Q502W7 563 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 PYCR3Q53H96 274 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 DHRS13Q6UX07 377 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 TAF8Q7Z7C8 310 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 CREG2Q8IUH2 290 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 SLC35F3Q8IY50 421 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 GLYATL1Q969I3 302 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 TBATAQ96M53 351 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 KCND1Q9NSA2 647 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 GULP1Q9UBP9 304 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 NEU2Q9Y3R4 380 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 C2orf81A6NN90 581 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 E7EVH7 732 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 CES2O00748 559 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 TPP1O14773 563 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 SUN1O94901 812 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 KRT14P02533 472 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 PYGLP06737 847 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 APRTP07741 180 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 PRSS56P0CW18 603 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ALPPL2P10696 532 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 TCP1P17987 556 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 BASP1P80723 227 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 DAB2P98082 770 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 XIAPP98170 497 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 CTBSQ01459 385 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 PEX6Q13608 980 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 SEPT6Q14141 434 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ELOCQ15369 112 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 GUSBP11Q6P575 273 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-210ENST00000488157 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms