RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 SPATA13Q96N96 652 aa29.07■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 OR2M4Q96R27 311 aa29.07■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa29.07■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 RABGEF1Q9UJ41 708 aa29.07■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ANXA9O76027 345 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 HLA-DPA1P20036 260 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 DCDC1P59894 354 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 CYP4F3Q08477 520 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 OLIG2Q13516 323 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 PYCR3Q53H96 274 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 SEL1L2Q5TEA6 688 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 OGFOD3Q6PK18 319 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 TTC30BQ8N4P2 665 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 CDH19Q9H159 772 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 RAD18Q9NS91 495 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 TAAR2Q9P1P5 351 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 PRKAB1Q9Y478 270 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa29.06■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 PRPSAP1Q14558 356 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF569Q5MCW4 686 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 GALNT13Q8IUC8 556 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 FAM71DQ8N9W8 422 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 DEPDC7Q96QD5 511 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 APOL2Q9BQE5 337 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa29.05■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 BUD23O43709 281 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 DNAJC6O75061 913 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 CSO75390 466 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 FGF1P05230 155 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 C14orf28Q4W4Y0 310 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 MEI1Q5TIA1 1274 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 TRAM1L1Q8N609 369 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ATG4AQ8WYN0 398 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 TRABDQ9H4I3 376 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 VPS18Q9P253 973 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 TAF4O00268 1085 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 NRDCO43847 1150 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 HMGCLP35914 325 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ACTR1BP42025 376 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 MAZP56270 477 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ACTR1AP61163 376 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 RPS6KA1Q15418 735 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF662Q6ZS27 426 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 SLC35B2Q8TB61 432 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ALS2CR12Q96Q35 445 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 HACD3Q9P035 362 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 C5orf60A6NFR6 353 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ADRA1AP35348 466 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 GDF10P55107 478 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 PROSER1Q86XN7 944 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 PATE1Q8WXA2 126 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 NXPE2Q96DL1 559 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM121Q9BTD3 319 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 ATXN10Q9UBB4 475 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 RNF215Q9Y6U7 377 aa29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
FBXO18-208ENST00000470089 USP12O75317 370 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 CCL7P80098 99 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 SPARCL1Q14515 664 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 CERCAMQ5T4B2 595 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 RANBP10Q6VN20 620 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 OR6C4Q8NGE1 309 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 GLYATL1Q969I3 302 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 OR2AG1Q9H205 316 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 IL17CQ9P0M4 197 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 LRIT1Q9P2V4 623 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 AK5Q9Y6K8 562 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 CACNA1BQ00975 2339 aa29.01■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 ECEL1O95672 775 aa29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 GLB1P16278 677 aa29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 PDPK2PQ6A1A2 396 aa29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 NRSN2Q9GZP1 204 aa29■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 MTX2O75431 263 aa28.99■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 SPIDRQ14159 915 aa28.99■■■□□ 2.23
FBXO18-208ENST00000470089 PTPRCAPQ14761 206 aa28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms