RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CLPB	Q9H078	707 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MRAS	O14807	208 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ANGPT2	O15123	496 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJA2	O60884	412 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE5A	O76074	875 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PGLS	O95336	258 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC24A	O95486	1093 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ESRRB	O95718	433 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	F11	P03951	625 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	KLKB1	P03952	638 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CBSL	P0DN79	551 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	IRF1	P10914	325 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	RAG1	P15918	1043 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DGKA	P23743	735 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FMO4	P31512	558 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CBS	P35520	551 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PLK1	P53350	603 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PSME3	P61289	254 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ARF5	P84085	180 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DMC1	Q14565	340 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758		Q6ZNB5	142 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SCLY	Q96I15	445 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DEFB118	Q96PH6	123 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF382	Q96SR6	550 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF208	Q9H0X6	261 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	LHX3	Q9UBR4	397 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DHRS7	Q9Y394	339 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	UTRN	P46939	3433 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	UBXN8	O00124	270 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	KPNA5	O15131	536 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FZD6	O60353	706 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF15	O94989	841 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ADH1A	P07327	375 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CCL5	P13501	91 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	UQCRB	P14927	111 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CHRM3	P20309	590 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	GMPR	P36959	345 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CCL23	P55773	120 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNK10	P57789	538 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	INPP5A	Q14642	412 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIP10	Q15642	601 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.43	□□□□□ -0.58

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