RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 ANP32DO95626 131 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 TRBC1P01850 177 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 FGF4P08620 206 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 BMPR1AP36894 532 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNC1P48547 511 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 E2F5Q15329 346 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ACSBG2Q5FVE4 666 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CHSY3Q70JA7 882 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PELI3Q8N2H9 469 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 STMN2Q93045 179 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 LYSMD1Q96S90 227 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC1Q99614 292 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP44Q9C0F1 390 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 HS3ST2Q9Y278 367 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 C15orf41Q9Y2V0 281 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SCN8AQ9UQD0 1980 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 NEMP1O14524 444 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 STX16O14662 325 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 KLK8O60259 260 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PRSS56P0CW18 603 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 MTHFD2P13995 350 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.562e-6■■□□□ 14.3
SH3BP2-202ENST00000435136 TCF3P15923 654 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ACTR3P61158 418 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ERVK-21P61565 698 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 OR4D1Q15615 310 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2AP1Q8NGE2 309 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PHF21BQ96EK2 531 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 P2RY12Q9H244 342 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 APPL1Q9UKG1 709 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A088AWK7 358 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PQ67 120 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMG1O95456 288 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPN2P17706 415 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SERPINA4P29622 427 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 DMC1Q14565 340 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CTSL3PQ5NE16 218 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 GPR21Q99679 349 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ACSS2Q9NR19 701 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 STOML1Q9UBI4 398 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CAPN8A6NHC0 703 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BMM5 538 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 K7ERQ8 282 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SUPT7LO94864 414 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 POU2F2P09086 479 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ITGAXP20702 1163 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CD70P32970 193 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PITRM1Q5JRX3 1037 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 C16orf89Q6UX73 402 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CMTM8Q8IZV2 173 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CLYBLQ8N0X4 340 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR60Q8WVS4 1066 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-202ENST00000435136 GRM6O15303 877 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CCL16O15467 120 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP4BP51164 291 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ERVFC1P60507 584 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CDC16Q13042 620 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SMIM14Q96QK8 99 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF112Q9ULX5 631 aa18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms