RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366365.2

SNHG20-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 20, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG20, Length 1,028 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG20-201ENST00000366365 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 RFFLQ8WZ73 363 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ERGIC2Q96RQ1 377 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 CALN1Q9BXU9 219 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 NLRC4Q9NPP4 1024 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 NLGN3Q9NZ94 848 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 KNTC1P50748 2209 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ACACAQ13085 2346 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SMTNL1A8MU46 457 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 K7ERQ8 282 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 GSC2O15499 205 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 KDELR3O43731 214 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 IGSF6O95976 241 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 XPAP23025 273 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 DGKAP23743 735 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 EPHB2P29323 1055 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 YPEL5P62699 121 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ELP6Q0PNE2 266 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 BNIP3Q12983 259 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SHBQ15464 509 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 MYLK3Q32MK0 819 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 MANEALQ5VSG8 457 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 NLRP14Q86W24 1093 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 PARGQ86W56 976 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 EMC1Q8N766 993 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 WDR48Q8TAF3 677 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ARRDC3Q96B67 414 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 TBATAQ96M53 351 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 CNPY3Q9BT09 278 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ABCG4Q9H172 646 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ANLNQ9NQW6 1124 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 MKS1Q9NXB0 559 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ZNF212Q9UDV6 495 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 FADS3Q9Y5Q0 445 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 X6R8D5 127 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 A0A087WV48 116 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 C16orf96A6NNT2 1141 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 I6L893 689 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 PLK4O00444 970 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 KRIT1O00522 736 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 TPP1O14773 563 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SCAMP1O15126 338 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 BUB1O43683 1085 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 COL6A2P12110 1019 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 PRLRP16471 622 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 FPR2P25090 351 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 NFKBIAP25963 317 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ACTN2P35609 894 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 BLKP51451 505 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 THOP1P52888 689 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 METAP1P53582 386 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ARF5P84085 180 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 RTP5Q14D33 572 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 CFAP58Q5T655 872 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 HES3Q5TGS1 186 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 Q6ZSR6 202 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 MDM1Q8TC05 714 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SLC20A1Q8WUM9 679 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 AGPAT1Q99943 283 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 TTYH3Q9C0H2 523 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 PARVAQ9NVD7 372 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SPASTQ9UBP0 616 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 DKK3Q9UBP4 350 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 GULP1Q9UBP9 304 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 DNAI1Q9UI46 699 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 CLCA2Q9UQC9 943 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 SNX10Q9Y5X0 201 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 MRFAP1Q9Y605 127 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG20-201ENST00000366365 ZZEF1O43149 2961 aa10.58□□□□□ -0.72
SNHG20-201ENST00000366365 CACNA1GO43497 2377 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms