RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363350.1

RNU6-179P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 179, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-179P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 KLHL1Q9NR64 748 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SETD4Q9NVD3 440 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 COPG2Q9UBF2 871 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 MALT1Q9UDY8 824 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 LOXL2Q9Y4K0 774 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 KANSL1LA0AUZ9 987 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 FSD2A1L4K1 749 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 LILRA5A6NI73 299 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 AGAP14A8MT82 685 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 MAP2K7O14733 419 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 IKBKBO14920 756 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 KCNN4O15554 427 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 TGFB3P10600 412 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 HLA-DOBP13765 273 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 GABRB1P18505 474 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 UGT1A1P22309 533 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 HOXD13P35453 343 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 PSMB10P40306 273 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMPOP42166 694 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 PIK3CAP42336 1068 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRCPP42785 496 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 GALCP54803 685 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 CDH8P55286 799 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 RELQ04864 619 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC20A2Q08357 652 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 CRYMQ14894 314 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 RALBP1Q15311 655 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 NAB2Q15742 525 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 C18orf63Q68DL7 685 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 CLEC17AQ6ZS10 378 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 CHST9Q7L1S5 443 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMEM219Q86XT9 240 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 TTC39CQ8N584 583 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 THAP6Q8TBB0 222 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ELMOD3Q96FG2 381 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 IGSF21Q96ID5 467 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 PKP4Q99569 1192 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SIL1Q9H173 461 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 STK39Q9UEW8 545 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 VDAC3Q9Y277 283 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 CGNL1Q0VF96 1302 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 A0A0G2JPF8 293 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 A0A1W2PP11 408 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ANKRD28O15084 1053 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACTN1P12814 892 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 MYOD1P15172 320 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMEM11P17152 192 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ITGA2P17301 1181 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 MCM3P25205 808 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 USP8P40818 1118 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 CAMPP49913 170 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 GPR143P51810 404 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 GAS1P54826 345 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 RRP1P56182 461 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 CLDN20P56880 219 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 ERVFC1-1P60608 527 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 RUNX1T1Q06455 604 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SPOCK1Q08629 439 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 SREBF2Q12772 1141 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 LRMPQ12912 555 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-179P-201ENST00000363350 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms