RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF639Q9UID6 485 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 KLF15Q9UIH9 416 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 NCANO14594 1321 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 HDAC3O15379 428 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ALDH2P05091 517 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 GNAO1P09471 354 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 AMD1P17707 334 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PPIL2Q13356 520 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RAB12Q6IQ22 244 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MND1Q9BWT6 205 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF38Q9H0F5 515 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 IQGAP1P46940 1657 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 C5orf60A6NFR6 353 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ITPKBP27987 946 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 FMO3P31513 532 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CDH4P55283 916 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 FBXL19Q6PCT2 694 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 OR2T12Q8NG77 320 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RDH11Q8TC12 318 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 UBE2E3Q969T4 207 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 S100PBPQ96BU1 408 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 AP1S3Q96PC3 154 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TTLL2Q9BWV7 592 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SGK2Q9HBY8 427 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 POU2F1P14859 743 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 COLEC12Q5KU26 742 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RETSATQ6NUM9 610 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 BEND5Q7L4P6 421 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SPATA19Q7Z5L4 167 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ACAT2Q9BWD1 397 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNA5P22460 613 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SKP1P63208 163 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 NFIXQ14938 502 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SYCE2Q6PIF2 218 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 LZTR1Q8N653 840 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 VCPIP1Q96JH7 1222 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PPM1MQ96MI6 270 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF570Q96NI8 536 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 COMMD3Q9UBI1 195 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF208O43345 1280 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MAGEC1O60732 1142 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ITGAVP06756 1048 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 KLRC2P26717 231 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RGS19P49795 217 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PITPNAQ00169 270 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DNASE1L3Q13609 305 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MOXD1Q6UVY6 613 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TRABD2AQ86V40 505 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TBCBQ99426 244 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MYOZ2Q9NPC6 264 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 AASSQ9UDR5 926 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 METTL21EPA6NDL7 271 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 FOXO6A8MYZ6 492 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 GATBO75879 557 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SERPINA4P29622 427 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RPL3P39023 403 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CUZD1Q86UP6 607 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SPAG16Q8N0X2 631 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 BBIP1A8MTZ0 92 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CYP1A2P05177 515 aa10.98□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CXCR2P25025 360 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms