RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 VOPP1Q96AW1 172 aa6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CPNE1Q99829 537 aa6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 KCTD3Q9Y597 815 aa6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.05□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 C5orf42Q9H799 3197 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PPM1 405 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 PRRT4C9JH25 899 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 M0QX08 132 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ARNTLO00327 626 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 BNIP3LO60238 219 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 VAPBO95292 243 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CRTAMO95727 393 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 EPB42P16452 691 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ARNTP27540 789 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SERPINA4P29622 427 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 HADHAP40939 763 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 STT3AP46977 705 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 GRIA4P48058 902 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SERPINB9P50453 376 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 DAB2P98082 770 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SMIM14Q96QK8 99 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 AGAP2Q99490 1192 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 COQ7Q99807 217 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 PSAT1Q9Y617 370 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 WASH3PC4AMC7 463 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CNTFP26441 200 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ATP1A2P50993 1020 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 EPHB1P54762 984 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 GRM3Q14832 879 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 GRTP1Q5TC63 336 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CHST14Q8NCH0 376 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CHFRQ96EP1 664 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 TRABDQ9H4I3 376 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 AURKAO14965 403 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SIN3BO75182 1162 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 KRT37O76014 449 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 BMP1P13497 986 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CREB1P16220 341 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ST8SIA6P61647 398 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ACVR1Q04771 509 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 RAD51Q06609 339 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 LGSNQ5TDP6 509 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 TERB1Q8NA31 727 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 STYXQ8WUJ0 223 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 PEX13Q92968 403 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 MTBPQ96DY7 904 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SENP1Q9P0U3 644 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 GGT7Q9UJ14 662 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.03□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.03□□□□□ -1.44
CCR6-201ENST00000341935 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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