RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 ETS1P14921 441 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 FDFT1P37268 417 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 NRROSQ86YC3 692 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PRELID2Q8N945 189 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC89Q8N998 374 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GLYATL1Q969I3 302 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 IL26Q9NPH9 171 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 KLK13Q9UKR3 277 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PKP3Q9Y446 797 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 AKAP13Q12802 2813 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PSMD3O43242 534 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 DNAJC6O75061 913 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PPFIA2O75334 1257 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 CDK4P11802 303 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ACTN2P35609 894 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 SPAM1P38567 509 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ADCY8P40145 1251 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 NR0B2Q15466 257 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PYCR3Q53H96 274 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GLMNQ92990 594 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 MS4A14Q96JA4 679 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 VPS35Q96QK1 796 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 OR2M4Q96R27 311 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.871e-5■□□□□ 8
RNPS1-201ENST00000301730 PAK5Q9P286 719 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GPR34Q9UPC5 381 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ACACBO00763 2458 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 BPTFQ12830 3046 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 C2orf81A6NN90 581 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 KCNJ1P48048 391 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 SEMA5AQ13591 1074 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PTPRCAPQ14761 206 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GUSBP11Q6P575 273 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ARL10Q8N8L6 244 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 KYQ8NBH2 561 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 COG1Q8WTW3 980 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 SNX12Q9UMY4 172 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 KCTD3Q9Y597 815 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 CRTAMO95727 393 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GP1BAP07359 652 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 RPIAP49247 311 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 CTBSQ01459 385 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 LINC00523Q86TU6 105 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 GPR156Q8NFN8 814 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 IFI44Q8TCB0 444 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 RMI1Q9H9A7 625 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-201ENST00000301730 RP1P56715 2156 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms