RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000067837.9

Rnf6-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rnf6, Length 2,388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ldb1P70662 411 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 NyxP83503 476 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tmem184cQ3TPR7 525 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gstt1Q64471 240 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Fnip1Q68FD7 1165 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 AftphQ80WT5 931 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gxylt2Q810K9 444 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Kyat1Q8BTY1 424 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 MafaQ8CF90 359 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Usp45Q8K387 813 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Lgals12Q91VD1 314 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ppa2Q91VM9 330 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Dio3Q91ZI8 304 aa11.85□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Rhox3fA2ANE1 215 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Zfp362B1ASA5 418 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gm8011K7N6Y5 207 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ptpn22P29352 802 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Man1a1P45700 655 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ppp3ccP48455 513 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tas2r16P59529 299 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ext2P70428 718 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Hrh2P97292 397 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Xrra1Q3U3V8 786 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Lsmem1Q3UQS2 128 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Fscn1Q61553 493 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Grik4Q8BMF5 956 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Lig4Q8BTF7 911 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 PdgfcQ8CI19 345 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Dapk2Q8VDF3 370 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Lrrc40Q9CRC8 602 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cntd1Q9D995 334 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Nectin1Q9JKF6 515 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Rdh11Q9QYF1 316 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 TriqkB2B9E1 86 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Mybpc1D3YU50 1127 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Slc28a1E9PXX9 648 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Akain1G3UWD5 69 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Vmn2r38G3UYA8 861 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Vmn2r33K7N705 861 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 H2-M9O19442 342 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Sptlc1O35704 473 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tmem247Q497K7 211 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cyp2c67Q569X9 491 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 SctrQ5FWI2 447 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Lrrc8eQ66JT1 795 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Sfr1Q8BP27 319 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ppp1r3eQ8BRJ4 279 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Zcchc14Q8VIG0 956 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Smim14Q91VT8 99 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Lims2Q91XD2 341 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tex13bQ99MW5 186 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Yif1bQ9CX30 311 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cog8Q9JJA2 640 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 LctF8VPT3 1931 aa11.84□□□□□ -0.51
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Slc43a3A2AVZ9 502 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Rdh7O88451 316 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ctbp1O88712 441 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 CtsdP18242 410 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 PthlhP22858 175 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cyp2f2P33267 491 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 ErfP70459 551 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gm7030Q0WXH6 285 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ccbe1Q3MI99 408 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Parp8Q3UD82 852 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Zzz3Q6KAQ7 910 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Rad9bQ6WBX7 403 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Teddm1aQ810U2 305 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 PdhxQ8BKZ9 501 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Olfr695Q8VFM3 315 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tfap2dQ91ZK0 452 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 EedQ921E6 441 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Nudt17Q9CWD3 296 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Sesn3Q9CYP7 492 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 CinpQ9D0V8 212 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 9030624G23RikQ9D308 155 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Slc28a3Q9ERH8 703 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Jam2Q9JI59 298 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gpc6Q9R087 555 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 PtsQ9R1Z7 144 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Plxna4Q80UG2 1893 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gm4756A0A140LIS8 335 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 L3mbtl1A2A5N8 826 aa11.83□□□□□ -0.52
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Slc16a6B1AT66 607 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms