RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031377.8

Scarb2-201, Transcript of Lysosome membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scarb2, Length 4,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2-201ENSMUST00000031377 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tmed11Q9D2R4 215 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Stx11Q9D3G5 287 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam166bA2AIP0 273 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Itga8A2ARA8 1062 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Surf2P09926 257 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PfkmP47857 780 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gabrr2P56476 465 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Erp29P57759 262 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Smad5P97454 465 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tigd3Q7TM95 470 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sept8Q8CHH9 429 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc35a5Q921R7 437 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mrpl46Q9EQI8 283 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cog8Q9JJA2 640 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Greb1lB9EJV3 1913 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Phf11cB4XVP9 339 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 NoctO35710 429 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Prkag1O54950 330 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rrm2P11157 390 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hsd11b2P51661 386 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Inf2Q0GNC1 1273 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Naa11Q3UX61 218 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc6a3Q61327 619 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PtprrQ62132 656 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Q8BZE1 841 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 ProzQ9CQW3 399 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rhox9Q9EQM5 227 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Znhit2Q9QY66 399 aa13.45□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nlrp1bA1Z198 1177 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pik3cdO35904 1043 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 ChgbP16014 677 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Smpdl3aP70158 445 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Npy2rP97295 381 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cpne9Q1RLL3 553 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 NkaplQ5SZT7 395 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam149b1Q6NSV7 578 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr293Q7TS10 336 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Parp9Q8CAS9 866 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc8a2Q8K596 921 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Far1Q922J9 515 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Klhl35Q9CZ49 574 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1145A2AVC7 325 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zmynd12A2BGJ5 363 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Itih4A6X935 942 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam181aJ3QNB7 292 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Grk4O70291 574 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc22a23Q3UHH2 689 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Arhgef9Q3UTH8 516 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Q5EBG8 199 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cep44Q5HZK1 386 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 StyxQ60969 223 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ntan1Q64311 310 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bfsp2Q6NVD9 416 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bend6Q6PFX2 281 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Defb34Q7TNV8 81 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Trnp1Q80ZI1 223 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Msantd1Q8BIL2 278 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 SgtaQ8BJU0 315 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Aph1bQ8C7N7 257 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vmn1r203Q8R273 311 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bcas2Q9D287 225 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cib4Q9D9N5 185 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hmg20aQ9DC33 346 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Insl5Q9WUG6 135 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Psmd7P26516 321 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 UtyP79457 1212 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fmo5P97872 533 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Osbp2Q5QNQ6 908 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Eif2b4Q61749 524 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 StgQ8BM15 349 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nmur2Q8BZ39 395 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hkdc1Q91W97 915 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cyp4f3Q99N16 524 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa13.44□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 IqccA2ADZ8 418 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Trim15G3UY57 292 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam71e2L7N480 754 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PrkcgP63318 697 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Adgre1Q61549 931 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Atg16l2Q6KAU8 623 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mon1aQ6PDG8 556 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp606Q7TSV0 794 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ubp1Q811S7 540 aa13.43□□□□□ -0.26
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.5 ms