RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LactbQ9EP89 551 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dap3Q9ER88 391 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il22Q9JJY9 179 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ing1Q9QXV3 279 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galk1Q9R0N0 392 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdh17Q9R100 827 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adgra2Q91ZV8 1336 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1200A2ATJ4 336 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PotegA5H0M4 473 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01673 111 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifrd1P19182 449 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BdnfP21237 249 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pdha2P35487 391 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tial1P70318 392 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpat2Q14DK4 801 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ankrd42Q3V096 527 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plk5Q4FZD7 595 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adora2aQ60613 410 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ip6k1Q6PD10 433 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Teddm1aQ810U2 305 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifi44Q8BV66 422 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbmx2Q8R0F5 326 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr330Q8VGD9 315 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sp7Q8VI67 428 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp4f15Q99N18 534 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phf10Q9D8M7 497 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plod2Q9R0B9 737 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pkd2l1A2A259 760 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 L3mbtl1A2A5N8 826 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp563B8JJZ9 448 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r76F8VQ63 324 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TpteG5E8H5 664 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hoxd4P10628 250 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CtswP56203 371 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem207P86045 143 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B3gntl1Q3U129 357 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrm3Q5ND52 418 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q6GQU0 248 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Garem2Q6PAJ3 880 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ints6Q6PCM2 883 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scgb2b2Q6UGQ3 114 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ssxb3Q6XAS4 170 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plekha8Q80W71 519 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HomezQ80W88 542 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Siglec10Q80ZE3 688 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam161aQ8QZV6 448 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pla2g15Q8VEB4 412 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr441Q8VFS5 310 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Reep3Q99KK1 254 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9CXL3 195 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nek6Q9ES70 313 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajc12Q9R022 198 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psma4Q9R1P0 261 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa9.91□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpine3E9Q6A2 401 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2w1E9Q816 493 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sult3a2G5E904 293 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spp1P10923 294 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Casp2P29594 452 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptpn5P54830 541 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lim2P56563 173 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lpar1P61793 364 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ZbbxQ0P5X5 716 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plcl1Q3USB7 1096 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc8eQ66JT1 795 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cfap97Q6ZPR1 541 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppp1r3eQ8BRJ4 279 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim16Q99PP9 556 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptges3lQ9D9A7 131 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Efcab9Q9DAM2 216 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif3fQ9DCH4 361 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10721J3QPJ9 223 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CrymO54983 313 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tpst2O88856 376 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ItgamP05555 1153 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gsta2P10648 222 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ThbdP15306 577 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd247P24161 164 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dpf3P58269 378 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PdxpP60487 292 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnq1P97414 668 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp9bP98195 1146 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aqp1Q02013 269 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Emx1Q04742 257 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam83fQ3UKU4 495 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lgr6Q3UVD5 967 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mfsd3Q5U419 412 aa9.9□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smpd4Q6ZPR5 823 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.5 ms