RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KDM1A	O60341	852 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	NOBOX	O60393	691 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GJB3	O75712	270 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGB1	P05556	798 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	NAA20	P61599	178 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	RHD	Q02161	417 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	NPHS1	O60500	1241 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP2C18	P33260	490 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CARTPT	Q16568	116 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PIGG	Q5H8A4	983 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TSSK3	Q96PN8	268 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525		J3QRK9	145 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGEB3	O15480	346 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ALDH2	P05091	517 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	STT3A	P46977	705 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNQ1	P51787	676 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	AIF1	P55008	147 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SPIDR	Q14159	915 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DMC1	Q14565	340 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	HAL	P42357	657 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	HSPA7	P48741	367 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CDKN2D	P55273	166 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	UFM1	P61960	85 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ACBD6	Q9BR61	282 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ASB8	Q9H765	288 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM165	Q9HC07	324 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	EVPLL	A8MZ36	301 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNH1	O95259	989 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CST1	P01037	141 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CKM	P06732	381 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CAPN1	P07384	714 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OCM2	P0CE71	109 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GLDC	P23378	1020 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGEA3	P43357	314 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGEA6	P43360	314 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP3CC	P48454	512 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CCT8	P50990	548 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	BNIP3	Q12983	259 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LRCH3	Q96II8	777 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CHID1	Q9BWS9	393 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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