RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	TLR5	O60602	858 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	JCHAIN	P01591	159 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV3-27	P01718	113 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINB5	P36952	375 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CTBS	Q01459	385 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RING1	Q06587	406 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KCNJ8	Q15842	424 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	AFMID	Q63HM1	303 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	XKR5	Q6UX68	686 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF786	Q8N393	782 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC15A4	Q8N697	577 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	S100Z	Q8WXG8	99 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RCN3	Q96D15	328 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TEKT5	Q96M29	485 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TCF12	Q99081	682 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MPP6	Q9NZW5	540 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ALDH1A2	O94788	518 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	VAPB	O95292	243 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HMBS	P08397	361 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RHOQ	P17081	205 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BNIP3	Q12983	259 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ITGAD	Q13349	1161 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MAPRE2	Q15555	327 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FGD3	Q5JSP0	725 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GPR107	Q5VW38	600 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	STEAP4	Q687X5	459 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MPP5	Q8N3R9	675 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BHMT	Q93088	406 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MAGED4	Q96JG8	741 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		15.28	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CLDN25	C9JDP6	229 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HDAC3	O15379	428 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CPNE6	O95741	557 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	UROD	P06132	367 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NFKB1	P19838	968 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CDH15	P55291	814 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OCA2	Q04671	838 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ITIH5	Q86UX2	942 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RMND5A	Q9H871	391 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		15.27	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC22A1	O15245	554 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MAFK	O60675	156 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AP2A1	O95782	977 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NTRK1	P04629	796 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PKNOX1	P55347	436 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAB33A	Q14088	237 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SNX31	Q8N9S9	440 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IL23A	Q9NPF7	189 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		15.27	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CENPBD1	B2RD01	187 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TPP1	O14773	563 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RGS13	O14921	159 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MATN3	O15232	486 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CFLAR	O15519	480 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFB5	O43674	189 aa		15.26	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03

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