RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF805Q5CZA5 627 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 NPNTQ6UXI9 565 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP14Q86W24 1093 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 LZTR1Q8N653 840 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM53CQ9NYF3 392 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SPASTQ9UBP0 616 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 WASH4PA8MWX3 477 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM72CH0Y354 149 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 H7C0C1 242 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TP73O15350 636 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 LRIG2O94898 1065 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM153BP0C7A2 387 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5OP48047 213 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM153CQ494X1 144 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ALS2CLQ60I27 953 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM72BQ86X60 149 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO25Q8TCJ0 367 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 BTN2A2Q8WVV5 523 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC3Q9BQI4 270 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TXLNGYQ9BZA5 131 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 HEY1Q9Y5J3 304 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 YY2O15391 372 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PPFIA2O75334 1257 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFSF15O95150 251 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MX2P20592 715 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB6P35237 376 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 GBE1Q04446 702 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CBLBQ13191 982 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SLMAPQ14BN4 828 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 P3H1Q32P28 736 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 C5orf60A6NFR6 353 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SASH3O75995 380 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 GSRP00390 522 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA2BP08514 1039 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TSHRP16473 764 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MORF4L2Q15014 288 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC73Q5JTD7 316 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 RELL1Q8IUW5 271 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 EXD3Q8N9H8 876 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 NAT6Q93015 286 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PHACTR1Q9C0D0 580 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ETNK2Q9NVF9 386 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PAK5Q9P286 719 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PADI4Q9UM07 663 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC187A0A096LP49 1063 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 NOBOXO60393 691 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT2B4P06133 528 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHB2P29323 1055 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MACC1Q6ZN28 852 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 HOOK3Q86VS8 718 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCKQ8N0W5 287 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL14Q8N4G2 192 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2AP1Q8NGE2 309 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CLMPQ9H6B4 373 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP4O75096 1905 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN8AQ9UQD0 1980 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MTSS1O43312 755 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA8P53708 1063 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 YPEL5P62699 121 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GPS1Q13098 491 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 MYLK3Q32MK0 819 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00303Q3SY05 128 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms