RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-210ENST00000619438 TYK2P29597 1187 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.53■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 STK40Q8N2I9 435 aa21.5■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 TPH1P17752 444 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 GRK2P25098 689 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 NMBRP28336 390 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 POLD2P49005 469 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 RANBP10Q6VN20 620 aa21.5■■□□□ 1.03
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