RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SLC30A3Q99726 388 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RASSF1Q9NS23 344 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 G3V2T6 193 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CST1P01037 141 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GPIP06744 558 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PAMP19021 973 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GGT5P36269 586 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 HADHAP40939 763 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ATP6V0D1P61421 351 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DAG1Q14118 895 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SPATC1Q76KD6 591 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 S100ZQ8WXG8 99 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NUP205Q92621 2012 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 COPS5Q92905 334 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FEM1CQ96JP0 617 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 BBS2Q9BXC9 721 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NEK6Q9HC98 313 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 INVSQ9Y283 1065 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PLA2G6O60733 806 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 JRKO75564 520 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SOAT2O75908 522 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 APOA1P02647 267 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RBP1P09455 135 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CDH1P12830 882 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LBPP18428 481 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FOXA1P55317 472 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 OR4D2P58180 307 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 IER5LQ5T953 404 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TTC23Q5W5X9 447 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NUDT8Q8WV74 236 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FAM162AQ96A26 154 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ROPN1LQ96C74 230 aa6.65□□□□□ -1.34
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LMO3-235ENST00000616247 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GAD1Q99259 594 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ACOX2Q99424 681 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CASS4Q9NQ75 786 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FZD10Q9ULW2 581 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ILVBLA1L0T0 632 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 OR51F1A6NGY5 319 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 UBXN8O00124 270 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 DPYSL4O14531 572 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 AZIN1O14977 448 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ACOX3O15254 700 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 PGLSO95336 258 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 IQCF3P0C7M6 154 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CYP2B6P20813 491 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MATKP42679 507 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MAP3K7CLP57077 242 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 UFM1P61960 85 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CD47Q08722 323 aa6.65□□□□□ -1.35
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