RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	INPP4B	O15327	924 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NKX2-8	O15522	239 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZW10	O43264	779 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC172	P0C7W6	258 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PCK1	P35558	622 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	GPLD1	P80108	840 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PTS	Q03393	145 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	COX14	Q96I36	57 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0J9YYE9	177 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338		A6NCN8	305 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MU76	341 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD11	O43934	449 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC6	O75061	913 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBC1	P01850	177 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RARA	P10276	462 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NFKBIA	P25963	317 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL4A	P40617	200 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CCR10	P46092	362 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	STC1	P52823	247 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH6	P55285	790 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB15	P59190	212 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC20	Q12834	499 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ASIC2	Q16515	512 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	STX1A	Q16623	288 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR24	Q96S15	920 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC38A3	Q99624	504 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PRL	P01236	227 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CD48	P09326	243 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	GZMA	P12544	262 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CASR	P41180	1078 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKCI	P41743	596 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXK1	P85037	733 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MC2R	Q01718	297 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DSC2	Q02487	901 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	HHEX	Q03014	270 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NFATC2	Q13469	925 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX6	Q13608	980 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	LRP8	Q14114	963 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51

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