RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	DRC3	Q9H069	523 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	VPS51	Q9UID3	782 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	VPS28	Q9UK41	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	DCX	O43602	365 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CRTAM	O95727	393 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	FDXR	P22570	491 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MPST	P25325	297 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PSMA3	P25788	255 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TRAF2	Q12933	501 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CDH18	Q13634	790 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	RCN2	Q14257	317 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	OR4L1	Q8NH43	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	RMDN1	Q96DB5	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	BBS2	Q9BXC9	721 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	NFATC1	O95644	943 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PRSS56	P0CW18	603 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ADH5	P11766	374 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TYR	P14679	529 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CTH	P32929	405 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	NAGLU	P54802	743 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP8	P85298	464 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	KDSR	Q06136	332 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PDGFRL	Q15198	375 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	EPGN	Q6UW88	154 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	RINL	Q6ZS11	566 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PIM3	Q86V86	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	LSMEM2	Q8N112	164 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	DDI1	Q8WTU0	396 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SGF29	Q96ES7	293 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	FOXQ1	Q9C009	403 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	COG4	Q9H9E3	785 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	GPAM	Q9HCL2	828 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PIGN	O95427	931 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MT-CO1	P00395	513 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	AOC1	P19801	751 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	STC1	P52823	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJB13	P59910	316 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PFKP	Q01813	784 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PON2	Q15165	354 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TBCC	Q15814	346 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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