RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC7A4O43246 635 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CA3P07451 260 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 IDO1P14902 403 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBX4P57082 545 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SQLEQ14534 574 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 IHHQ14623 411 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPRED2Q7Z698 418 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SP110Q9HB58 689 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 VWA7Q9Y334 891 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 MROH6A6NGR9 719 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAPRE2Q15555 327 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ALFQ53S48 1182 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM64BA6NI03 449 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CBFA2T3O75081 653 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNTN5O94779 1100 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLK1P53350 603 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSME3P61289 254 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM189BP81408 668 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBED5Q49AG3 693 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 FIBCD1Q8N539 461 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TEX26Q8N6G2 289 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHF21BQ96EK2 531 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAD9AQ99638 391 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 MSRAQ9UJ68 235 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC36A6NLP5 189 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 INPPL1O15357 1258 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 B4GALT3O60512 393 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 S1PR4O95977 384 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 BMP2P12643 396 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR15P49685 360 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDKN2DP55273 166 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 STX5Q13190 355 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB30Q15771 203 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDR2Q16832 855 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 NHSL2Q5HYW2 709 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDAC10Q969S8 669 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMG2Q969U7 264 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TADA1Q96BN2 335 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TIFAQ96CG3 184 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 VPS50Q96JG6 964 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 DOK1Q99704 481 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD300AQ9UGN4 299 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1B0GTW7 788 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBDO15205 165 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARSAP15289 507 aa20.24■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNK2Q07912 1038 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLCO4A1Q96BD0 722 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 C8orf48Q96LL4 319 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADA2Q9NZK5 511 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 GMIPQ9P107 970 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 INSL6Q9Y581 213 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A087WXM4 84 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCL22O00626 93 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 IMPDH1P20839 514 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTKP33981 857 aa20.23■□□□□ 0.83
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