RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554672.5

ATXN3-229, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-229	ENST00000554672	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672		Q8N1Y9	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CLPB	Q9H078	707 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CDH19	Q9H159	772 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672		B2RBV5	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MTSS1	O43312	755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	VPS4B	O75351	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CLDN11	O75508	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MT-CO1	P00395	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SCG5	P05408	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PAEP	P09466	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ALPI	P09923	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SRC	P12931	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ADRB3	P13945	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CTSE	P14091	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ITIH1	P19827	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	NR2F2	P24468	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ETV5	P41161	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	BCL6	P41182	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	NUMB	P49757	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ITGA1	P56199	1179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PPARD	Q03181	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KLRB1	Q12918	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MTA1	Q13330	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ADAM9	Q13443	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CUL2	Q13617	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	STIL	Q15468	1287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	NFIL3	Q16649	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KY	Q8NBH2	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MIS12	Q9H081	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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