RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ANXA9	O76027	345 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	EPO	P01588	193 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	C1QTNF9	P0C862	333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	BPI	P17213	487 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ADRA1A	P35348	466 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GNPDA1	P46926	289 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GEM	P55040	296 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	NRROS	Q86YC3	692 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	KY	Q8NBH2	561 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GATA6	Q92908	595 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	COX14	Q96I36	57 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR34	Q9UPC5	381 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	APC2	O95996	2303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ACACA	Q13085	2346 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CPED1	A4D0V7	1026 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	LIAS	O43766	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	NRDC	O43847	1150 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	METTL18	O95568	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	IVL	P07476	585 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	DCDC1	P59894	354 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ILK	Q13418	452 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	NR0B2	Q15466	257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PERM1	Q5SV97	790 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	RANBP10	Q6VN20	620 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GKN2	Q86XP6	184 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM58	Q8NG06	486 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CARD9	Q9H257	536 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GULP1	Q9UBP9	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	OPA1	O60313	960 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	USP12	O75317	370 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	FGF1	P05230	155 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PYGL	P06737	847 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CXCR5	P32302	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CA5A	P35218	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ADCY8	P40145	1251 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CTBS	Q01459	385 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX1	Q13596	522 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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