RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ALG3Q92685 438 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 EXT2Q93063 718 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FBXO32Q969P5 355 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PHF21BQ96EK2 531 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 COQ10AQ96MF6 247 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CDRT15Q96T59 188 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RAB33BQ9H082 229 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TMEM117Q9H0C3 514 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KCNH6Q9H252 994 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PDZD7Q9H5P4 517 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SETD4Q9NVD3 440 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MALT1Q9UDY8 824 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KLQ9UEF7 1012 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FBXW11Q9UKB1 542 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 V9GYY5 206 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 UBE4BO95155 1302 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MAP3K19Q56UN5 1328 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 A0A0G2JNJ9 132 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ACOD1A6NK06 481 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NOTOA8MTQ0 251 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 E9PI62 339 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 STMND1H3BQB6 276 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DCLK1O15075 740 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MAPK13O15264 365 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 HBP1O60381 514 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ZNF254O75437 659 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KLHL18O94889 574 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 WDR47O94967 919 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 S100A6P06703 90 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TPM3P06753 285 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CSF1RP07333 972 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 OR52Z1P0C646 297 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MMP9P14780 707 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ARSAP15289 507 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CYP2A7P20853 494 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CALB2P22676 271 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MMP8P22894 467 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PTPN4P29074 926 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 EPHA3P29320 983 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 UQCRC1P31930 480 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 OTX2P32243 289 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 BMI1P35226 326 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MTHFSP49914 203 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ARSEP51690 589 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DGKQP52824 942 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CTSWP56202 376 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CARD18P57730 90 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 LILRA4P59901 499 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NKX3-2P78367 333 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GCNT1Q02742 428 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TAP2Q03519 686 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TMEM62Q0P6H9 643 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MESP2Q0VG99 397 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 BFSP2Q13515 415 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PTPRCAPQ14761 206 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PCOLCEQ15113 449 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MAPK11Q15759 364 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SLC18A3Q16572 532 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CCDC152Q4G0S7 254 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TIGD5Q53EQ6 642 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ARHGEF16Q5VV41 709 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PMS2CLQ68D20 193 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms