RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 SIX5Q8N196 739 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-209ENST00000550857 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 FAM228BP0C875 321 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 TFPIP10646 304 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
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