RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 DUX1O43812 170 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 MAP3K6O95382 1288 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 GZMAP12544 262 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 FASLGP48023 281 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PTSQ03393 145 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 STX1AQ16623 288 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SKIDA1Q1XH10 827 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SMIM14Q96QK8 99 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 AGAP2Q99490 1192 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 CTRCQ99895 268 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 INPP4BO15327 924 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 NKX2-8O15522 239 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PYGLP06737 847 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TCF4P15884 667 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SERPINB6P35237 376 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 EPHB1P54762 984 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 LRP8Q14114 963 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 NCAPHQ15003 741 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SFRP1Q8N474 314 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 BMPERQ8N8U9 685 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 EXD1Q8NHP7 514 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 NCSTNQ92542 709 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 RTP4Q96DX8 246 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 EPN3Q9H201 632 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PDP2Q9P2J9 529 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 A0A0J9YYE9 177 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.291e-14■■□□□ 14.3
CS-214ENST00000548849 FZD6O60353 706 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 EML2O95834 649 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TRBC1P01850 177 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 MYBL1P10243 752 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 RARAP10276 462 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PRKAR1AP10644 381 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ZNF30P17039 623 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 MC2RQ01718 297 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 HHEXQ03014 270 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 NFATC2Q13469 925 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 NLRP8Q86W28 1048 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TRIM11Q96F44 468 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PRKAB1Q9Y478 270 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 MAN1A1P33908 653 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 MAPK9P45984 424 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 KRT81Q14533 505 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TEX26Q8N6G2 289 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 COX14Q96I36 57 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 ZPBPQ9BS86 351 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 EFHD1Q9BUP0 239 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 KLHL3Q9UH77 587 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SNX2O60749 519 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 DNAJC6O75061 913 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 CLDN7O95471 211 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SKILP12757 684 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 STC1P52823 247 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 TEKT4Q8WW24 435 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-214ENST00000548849 SPRY4Q9C004 299 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms